Word, FBE(заглянуть в раздел скриптов, большинство глюков убрать поможет), но сильно не расчитывай, если бы все было так просто... ээээх... сам бы воспользовался с большим удовольствием...

FBE - сервис - слова. Показывает список сл-ов. Правда исправить прямо там неполучится - фича работает маленько некорректно. Вбиваем в поиск по одному и жмем "заменить все".

Лично я правку делаю в Файнридере. И после окончания правки по всей книге делается поиск на сочетание "дефис+разрыв строки" - занимает несколько минут. Мб на всяких учебниках будет сложнее.

Другой вариант - текст распознается в ФР и сохраняется без правки, т.е. сама правка в Ворде и тп прогах. Перед сохранением делается замена того же сочетания на что-то типа ####, а в Ворде замена на выделенный маркером дефис. Предполагается, что можно тут же пройтись по этим словам поиском, или во время вычитки обращать внимание.

Жизнь облегчает.

Контекстным поиском "[^ ]- " и правкой руками в каждом найденном слове.
Но куда хуже с пропущенными из-за переносом дефисами (розоватокоричневый, киборгбактерия, тудасюда...). Пока ловлю глазками. :(