Это удобно только и исключительно тем, что можно отследить рассказы, не вошедшие в с/с и сборники автора.
Для многоавторских сборников - разбивка на отдельные произведения удобна тем, что на странице автора отображается сам сборник, но названия и другой информации не видно и приходится лезть внутрь, чтобы увидеть, какая такая книга этого автора там лежит.

Ой какие тут агрессивные любители больших сборников!
А вот скажите, что делать, если я прочел (в бумаге) сб. "Вампиры. Опасные связи" серии "Лучшее" весом примерно 2 метра и нашел, что даже в электронном виде не хочу держать этот набор обрывков, садюшек и фантазий лесби-фетишисток. Из всего мне нужен 1 (один) последний рассказ, страниц на 30, около 100 кб с обложкой. Предлагаете тянуть 2 метра сборником ради 100 кб и самостоятельно выдирать?
Аналогично в сборнике "Живые и прочие: лучшая проза 2009 г." около 50% идет, как раньше в советских мясных отделах, - кости вместе с мясом. И я должен давиться мертвым огрызком Линор Горалик, чтобы почитать "10 ангелов Мартенбурга"? (Кстати, сборник "Живые и прочие" мне, например, целиком сделать не удастся - я не нахожу все опубликованное в нем в сети, поэтому выкладываю только найденные повести и рассказы. Пока кто-нибудь не купит и не отсканит его целиком, на Л. будут только отдельные тексты).

У одного и того же автора (у того же Чехова) сборников может быть немерено. И рассказы могут повторяться, а могут добавляться новые. Потом, когда качаешь сборник, никогда не знаешь, что внутри. Понадобился, к примеру, мне "Хамелеон", а я не знаю, в каком томе собрания сочинений или в сборнике он опубликован. Пока все не переберу, вряд ли найду...
В общем, я предпочитаю каждому произведению отдельный файл.

Отдельными рассказы - отдельными файлами!
Так гораздо удобнее. Может, я не хочу читать все подряд. А так сортировка работает, если еще качественные аннотации есть к отдельным файлам - вообще красота. Оценки и отзывы индивидуально ко всему опять же... Нет, только отдельными файлами. Впрочем, для желающих сборники тоже никто не запрещает выкладывать.

У всех свои аргументы, как обычно :) Но вот что важно это порядок пояавления сборников. Почему-то как правило сначала появляются рассказы россыпью, а только потом появляется (а иногда нет) сборник целиком. И вот смотришь, например, на рассказы Гамсуна и гадаешь: соизволит ли заливщик сборник собрать или поленится? Как бы так вежливо обязать попросить коллег поменять порядок выкладки? Ребята, вам ведь без разницы, а любителям сборников приятно...

Ну вот я, например, до сих пор выкладывал сборники раздербанеными по рассказам/повестям. Потому что, в большинстве случаев, этот сборник составлял какой-нибудь Хрен с Бугра, а мне на его мнение... накласть (с) Тимур Шаов. Но вот предпоследний сделанный сборник Мелкоу "Десять сигм" и добиваемый сейчас сборник Конни Уиллис "Вихри Мраморной арки" я сделал/делаю целиком только по одной причине - это АВТОРСКИЕ сборники. Рассказы в них подбирал автор, чтобы наиболее выпукло представить себя читателю. И кто я такой, чтобы игнорировать волю автора? В принципе, можно было бы (потом) побить сборник на отдельные рассказы. Но лень (с) О. Дивов. Если кто-то это сделает, я буду только приветствовать.

А идеале хотелось бы дать возможность читателям самостоятельно делать каждому для себя индивидуальные сборники (програмно обеспечить возможность при скачивании объединять выбранные произведения в один цельный файл).

Тогда можно все сборники не содержащие дополнительной ценной информации поудалять (авторские оставить) к черту и пусть каждый сам компонует любые произведения, как ему нравится. Интересно, это реализуемо?

Ну, в общем-то, это я выкладываю Аверченко. Поскольку не имею всего сразу, то выкладываю что сделано на данный момент из сборника находящегося в работе. На руках книг нет, в основе своей это обработка сканов серьезных библиотек выложенных в электронный архив (со старой орфографией и прочими прелестями). Перевод долгий и нудный. Ну нету у меня единственного максимально полного издания Аверченко в современной орфографии (в котором кстати многого нет), а на озоне за него 15к рублей просят.
Выкладываю с разбивкой по рассказам по нескольким причинам:
Возможна ссылка на отдельный рассказ. Названия не авторских, а с бору по сосенке собранных и изданных в бумаге рассказов совпадают с оригинальными названиями как сборников так и рассказов и возникает путаница. Есть возможность выборки необходимых для прочтения рассказов, а не всего сборника целиком.
И еще одна причина. Неудобность поиска внутренних ссылок оглавления фб2 в поисковых системах. Имеется в виду что если в выложенном на том же либрусеке сборнике присутствует рассказ, ну к примеру "Сазонов", то поисковая система (будь то гугл или яндекс) в 99% случаев пройдет мимо. Также (как мне показалось) не индексируется все что глубже информации о писателе, но тут могу ошибаться.
Стараюсь выложить максимально собранный авторский сборник (с оригинальной обложкой, содержанием и данными издательства), но не всегда это удается по разным причинам. (Из сборника "Могильные плиты" 1910 года издания у меня наличествуют только два рассказа из неизвестного количества, а информации по нему найти не могу.)
Я буду продолжать выкладывать Аверченко. Мне нравится его творчество. Сейчас занимаюсь авторскими сборниками, но дополнительно подготовлены рассказы публиковавшиеся в "Дешевой библиотеке Сатирикона" и в "Сатириконе", раритетные рассказы написанные в скитаниях как по России так и по Зарубежью и публиковавшиеся только в журнальном варианте. Ну и то что не вошло в большое издание Аверченко (неполные в этом издании сборники и невошедшие одноактные пьесы).
PS В общем, жду камней в свой огород...

Добавлю, что с удовольствием выложу (и могу в дальнейшем выкладывать) полными книгами собранные сборники, даже в случае если это не пойдет мне в рейтинг. В конце концов, минимальный рейт для скачивания у меня есть, а большего мне особо и не надо. Да и цель выкладывания Аверченко - наличие его произведений в сети в полном объеме. Если будет на это добро библиотекарей - соберу и выложу.

PS Но по отдельности рассказы тоже очень надо.

Потихоньку делаю Борис Ласкин "Избранное". Сделанные рассказы сразу выкладываю. Будет выложена отдельными рассказами, потом возможно, сделаю сборник в FB2, и добавлю сборник в Djvu.
ИМХО, в библиотеке должны быть в текстовом виде отдельные рассказы, очерки, статьи, сборники в текстовом виде и все издания в графическом.

Сторонники есть и у сборников и отдельных произведений.
Давайте обойдёмся без конфронтации.
Пусть кладут и те и другие.

Вставлю свои пять копеечек. Пара аргументов за рассказы отдельными файлами.

Аргумент №1. Часто бывает так, что пытаюсь найти рассказ, названия которого точно не помню. И тогда открываю страничку писателя и читаю по порядку названия всех его произведений в надежде на то, что когда увижу - узнаю. Как ни странно, метод срабатывает довольно часто. Так вот, если выкладывать только коллекции, найти в библиотеке рассказ будет возможно только зная его точное название (слава КПСС, недавно появился поиск в оглавлениях, раньше и того не было). Ну, либо пользоваться какими-то внешними библиографическими ресурсами.

Аргумент №2. У переводных произведений в [квадратных скобочках] часто бывает подписано оригинальное название. И таким образом рассказ можно найти по оригинальному названию, даже если самого оригинала в библиотеке нет. Если полагаться только на поиск в оглавлениях, такая опция станет недоступной. А переводы названий часто не имеют ничего общего с оригиналом (пример: Гарри Тертлдав, рус. "Битва в космосе" англ. "The World of Difference").

Наличие в библиотеке одновременно и коллекции одним файлом, и рассказов в рассыпуху - это, конечно, выход, но и тут есть нюанс. Получается, что мы имеем две (а то и больше) независимых друг от друга копий одного и того же текста, которые в принципе необходимо вычитывать синхронно. Только вот я сомневаюсь, что кто-то станет это регулярно делать - слишком уж много телодвижений. И это ж ещё надо догадаться, что рассказ, который я только что прочитал и вычитал, является частью другой книги, на которую я даже внимания не обратил, потому что она называется как-нибудь вроде "Сборник антивоенных научно-фантастических произведений". Ну и с точки зрения теории баз данных - явная денормализация.

В общем, я склоняюсь к публикации каждого рассказа отдельно, то есть к тезису, что электронная библиотека - это не собрание книг, а собрание литературных произведений. Одним файлом имеет смысл публиковать коллекции только таких рассказов, которые никогда (или очень давно) не публиковались по отдельности. Ну, типа "Марсианских хроник", например.